С того времени как Наруто вернулся в Коноху, после тренировок с Джираей, прошло 3 года. Естественно за это время он подрос, у него улучшилось качество исполнения некоторых техник. Сейчас ему уже 18 лет. За эти три года Наруто стал чуунином и это стало ещё одной ступенью на его пути к званию Хокаге. Сакура в свои 18 лет всё так же чуунин. За эти три года её навыки и сила значительно увеличились, она практически сравнялась с Цунаде, хотя это не удивительно, ведь многие говорили что Сакура может превзойти Цунаде. Теперь Сакура является вторым в деревне боевым медиком-ниндзя. Так же не без помощи Сакура открыла свой институт, в котором исследуют и разрабатывают новые лекарства и медицинские техники. Для девушки это стала неким подобием работы. В этом институте Сакуре помогает Ино. Девушки забыли былые обиды и теперь они вновь являются чуть ли не лучшими подругами. Хьюга Неджи теперь является членом АНБУ. Хатаке Какаши предлагали вернуться в АНБУ и возглавить один из отрядом, но он всё таки предпочёл оставить всё как есть, однако Цунаде не прекращает попыток его туда вернуть.
Пока в Конохе жизнь идёт размеренно, на её границах не всё так спокойно.
Патруль шиноби захватывает шпиона вражеской организации. При допросе этого шпиона выясняются новые, ни кому не известные факты о судьбе одной из самых опасных организаций – Акацки.
Опираясь на полученные данные, Совет старейшин и Цунаде приходят к выводу, что дабы предотвратить возможную угрозу для селения и Наруто нужно сформировать спец команды шиноби, которые смогут найти вражеское убежище и которые будут в состоянии незамеченными пробраться на вражескую территорию и на месте оценить степень предполагаемой угрозы.
Так же Цунаде принимает решение предупредить обо всё Казекаге, зная что он тоже находиться в опасности. Написав письмо, она отправляет его в суну, но это письмо перехватывают, при чём ни кто иные как Акацки. Прочитав его они понимают, что отправленный на разведку шпион был пойман, а так же узнают что он раскрыл всю известную ему информацию, но что бы не вызывать подозрений в перехватке письма они спустя некоторое время посылают с этой же птицей другое письмо, с яко бы ответом Гаары. Сразу как пришёл ответ от Казекаге Цунаде успокаивается, ни чего не заподозрив, хотя глубоко в душе нотки сомнения всё равно присутствуют. После отправки птицы Акацки начинают продумывать, что можно сделать в сложившейся ситуации.